Mede door de oververhitting beschadigen de hersencellen (neuronen). De uiteinden van deze neuronen, axonen genoemd, krimpen ineen, waardoor ze geen contact meer maken met andere neuronen.
Er wordt gedacht dat deze vorm van hersenschade door veel en vaak gebruik van XTC kan komen en versterkt wordt door oververhitting. Hoe groter de hoeveelheid MDMA die wordt ingenomen en hoe hoger de temperatuur is waarbij wordt gebruikt, des te groter is de kans op (langdurige) hersenbeschadigingen.